Konstruksi dibagi menjadi enam seksi, yaitu sebagai berikut.
- Seksi 1: JC Sleman - SS Banyurejo
- Seksi 2: SS Banyurejo - SS Borobudur
- Seksi 3: SS Borobudur - SS Magelang
- Seksi 4: SS Magelang - SS Temanggung
- Seksi 5: SS Temanggung - SS Ambarawa
- Seksi 6: SS Ambarawa - JC Bawen
Bagi masyarakat yang ingin melihat peta rute jalan Tol Jogja - Bawen bisa mengakses link berikut ini.