- Kalurahan Sidokarto, Godean
Kabupaten Bantul
- Kalurahan Sumberrahayu, Moyudan
- Kalurahan Argomulyo, Sedayu
- Kalurahan Argosari, Sedayu
Sementara itu pembebasan lahan di Kulon Progo belum dilaksanakan dalam waktu dekat karena izin penetapan lokasi (IPL) Kulon Progo belum turun.
Baca Juga: Gerbang Tol Solo - YIA di Sleman dan Kulon Progo, Ini Desa yang Dilalui Tol Jogja - Solo
Meski demikian daftar desa yang akan terdampak pembangunan tol di Kulon Progo sudah direncanakan. Berikut rinciannya:
- Desa Banguncipto
- Desa Palihan