2. Kecamatan Ngawen, Klaten, Jawa Tengah
3. Kecamatan Prambanan, Klaten, Jawa Tengah
4. Desa Purwomatani, Kalasan, Sleman
5. Kecamatan Gamping, Sleman
6. Kecamatan Sentolo, Kulonprogo
7. Kecamatan Wates, Kulonprogo
8. Bandara YIA, Kulonprogo
Adanya pembangunan jalan tol tentu membuat beberapa desa akan terdampak pembebasan lahan.
Baca Juga: Desa di Kulon Progo yang Dilewati Tol Jogja - Solo dan Rute Terbaru, Kapan IPL Turun?
Pembebasan lahan saat ini juga terus dilakukan oleh pihak terkait sembari pengerjaan konstruksi untuk wilayah yang sudah diterbitkan izin penetapan lokasinya.