Proses pembangunan konstruksi jalan Tol Jogja - Solo ini sendiri akan dibagi dalam tiga seksi pembangunan yang kembali terbagi dalam 2 seksi pengerjaan sebagai berikut.
Seksi 1 Kartosuro - Purwomartani sepanjang 42,38 kilometer
- Paket 1.1 Solo - Klaten sepanjang 22,30 kilometer
- Paket 1.2 Klaten Purwomartani sepanjang 20,08 kilometer
Seksi 2 Purwomartani - Gamping sepanjang 23,43 kilometer
- Paket 2.1 Purwomartani - Monjali sepanjang 9,43 kilometer
- Paket 2.2 Monjali - Gamping sepanjang 14 kilometer
Seksi 3 Gamping - Purworejo sepanjang 30,77 kilometer
- Paket 3.1 Gamping - Wates sepanjang 17,45 kilometer
- Paket 3.2 Wates - Purworejo sepanjang 13,32 kilometer
Untuk tersambung dengan Gunungkidul nantinya jalan Tol Jogja - Solo ini akan dibangun jalan dari exit tol di Bokoharjo yang mengarah ke Gayamharjo dan terhubung dengan jalan Tawang - Ngalang.
Sedangkan untuk rencana pintuu masuk dan keluar atau exit tol lainnya ada di beberapa lokasi. Gerbang Tol Solo - Jogja - YIA sendiri rencananya ada sebanyak 10 gerbang tol, sebagai berikut.
1. Gerbang Tol Colomadu/ Gerbang Tol Kartasura
2. Gerbang Tol Karanganom