- Kasdam V/Brawijawa (1996—1997)
- Asops Kasdam IX/Udayana (1997)
- Pangdam VI/Tanjung Pura (1997—1998)
- Komandan Jenderal Kopassus ke 16 (Maret-Mei 1998)
- Pati Mabes TNI (1999—2001)
- Deputi V BIN/Penggalangan (2001—2005)
- Agen BIN (2005—2006)
Setelah pensiun dari militer Indonesia, Muchdi Pr menjadi Ketua Dewan Kehormatan DPP Partai Berkarya tahun 2014.
Ia juga menjadi Ketua Umum Kwartir Pusat Gerakan Kepanduan Hizbul Wathan (2016—2021) dan terakhir, Muchdi Pr menjadi Ketua Umum DPP Partai Berkarya sejak tahun 2020.