Adapun keenam seksi pembangunan jalan Tol Jogja - Bawen tersebut adalah sebagai berikut.
1. Seksi 1 JC Sleman – SS Banyurejo sepanjang 8,25 km.
2. Seksi 2 SS Banyurejo – SS Borobudur sepanjang 15,26 km.
3. Seksi 3 SS Borobudur – SS Magelang sepanjang 8,08 km.
4. Seksi 4 SS Magelang – SS Temanggung sepanjang 16,26 km.