Berikut daftar desa yang terdampak pembangunan jalan Tol Jogja - Bawen di Magelang, Temanggung dan Semarang:
Kabupaten Temanggung
- Desa Kebumen
- Desa Pingit
Kota Magelang
- Desa Rejowinangun Utara
- Desa Tidar Utara
Kabupaten Semarang
- Desa Kandangan
- Desa Bawen
- Desa Doplang
- Desa Baran
- Desa Kupang
- Desa Pasekan
- Desa Panjang
- Desa Ngampin
- Desa Jambu
- Desa Gondoriyo
- Desa Kuwarasan
- Desa Kebondalem
- Desa Bedono
- Desa Gemawang
Kabupaten Magelang
- Desa Losari
- Desa Kalipucang
- Desa Grabag
- Desa Sidogede
- Desa Kartohargo
- Desa Banyusari
- Desa Kalikuto
- Desa Karangkajen
- Desa Donorejo
- Desa Candisari
- Desa Pucang
- Desa Madusari
- Desa Payaman
- Desa Jambewangi
- Desa Pancuranmas
- Desa Candiretno
- Desa Girirejo
- Desa Purwodadi
- Desa Glagahombo
- Desa Purwosari
- Desa Banyuurip
- Desa Tampingan
- Desa Mejing
- Desa Sidomulyo
- Desa Tempak
- Desa Podosoko
- Desa Tampir Kulon
- Desa Senden
- Desa Mungkid
- Desa Pagersari
- Desa Bojong
- Desa Pabelan
- Desa Tamanagung