Berikut daftar desa yang terdampak pembangunan jalan Tol Jogja - Bawen di Magelang, Temanggung dan Semarang, berdasarkan SK Gubernur Jateng, selengkapnya.
Kabupaten Temanggung
- Desa Kebumen
- Desa Pingit
Kota Magelang
- Desa Rejowinangun Utara
- Desa Tidar Utara
Kabupaten Semarang
- Desa Kandangan
- Desa Bawen
- Desa Doplang
- Desa Baran
- Desa Kupang
- Desa Pasekan
- Desa Panjang
- Desa Ngampin
- Desa Jambu
- Desa Gondoriyo
- Desa Kuwarasan
- Desa Kebondalem
- Desa Bedono
- Desa Gemawang
Kabupaten Mageleng
- Desa Losari
- Desa Kalipucang
- Desa Grabag
- Desa Sidogede
- Desa Kartohargo
- Desa Banyusari
- Desa Kalikuto
- Desa Karangkajen
- Desa Donorejo
- Desa Candisari
- Desa Pucang